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DDI-334:334 药物药物相互作用预测基准的代码与结果仓库
eda-ginger/ddi334-benchmark
来源与原文
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发布时间:(北京时间)
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https://github.com/eda-ginger/ddi334-benchmark
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AI 导读
GitHub 开源 DDI-334 基准的代码与结果,该基准基于 TWOSIDES 与 DrugBank 重叠构建,含 334 种药物,用于比较 Molecule/Relation/Document 信息源及 LLM 零样本与微调预测在 transductive(S0)和 inductive(S1、S2)划分下的药物相互作用预测表现。仓库提供复现论文全部数字、表格和图表所需的汇总指标、运行配置、loss 曲线及 S0/S1/S2 划分文件,涵盖 GAT、SchNet、ChemBERTa、BioBERT 等编码器、QLoRA 微调(6 模型 x 3 epochs)、KGE 对比与商业 LLM 对比实验。
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