arXiv · cs.AI· Alberto Martínez·· 13 天前AI 评分28
ProtModernBERT：面向计算高效蛋白质语言建模的新架构
ProtModernBERT: Compute-Efficient Protein Language Modeling
来源与原文
arXiv · cs.AI
作者：Alberto Martínez
发布时间：（北京时间）
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https://arxiv.org/abs/2610.19738v1
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AI 导读
研究者推出 ProtModernBERT，一种采用现代架构改进的 BERT 风格蛋白质语言模型，在氨基酸序列上预训练。该模型在二级结构、无序区和亚细胞定位预测及 ProteinGym 零样本基准上，性能与 Amplify-120M 和 ProtBert 相当，预训练 FLOPs 减少 80-90%，并缩小与 ESM2 的差距。分析表明现代架构组件带来的归纳偏置在低算力场景下比参数量更关键。
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