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arXiv · cs.AI· Ziwei Yang·· 12 小时前AI 评分10

HGPRGDel:面向生长耦合基因敲除设计的 GPR 感知学习与排序方法

HGPRGDel: GPR-Aware Learning and Ranking for Growth-Coupled Gene Deletion Design

来源与原文

arXiv · cs.AI

作者:Ziwei Yang

发布时间:(北京时间)

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完整链接与内容说明

https://arxiv.org/abs/2610.37478v1

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AI 导读

研究者提出 HGPRGDel 协议,通过显式建模基因-蛋白-反应(GPR)逻辑,为每个目标代谢物学习并排序基因敲除优先级,用于代谢工程中的生长耦合菌株设计。在 e_coli_core、iMM904 和 iML1515 上,该协议在所评估的学习配置中取得最高的 macro-F1 和 AUC,其排序平均能以比基线更少的基因考察量恢复 MetNetComp 参考敲除基因的 90%。

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