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RiboCouple 开源:将 RNA 骨架生成与序列设计相耦合
Jakkiabc/RiboCouple
来源与原文
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发布时间:(北京时间)
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https://github.com/Jakkiabc/RiboCouple
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AI 导读
RiboCouple 通过学习的残基对交互拓扑,将 RNA 骨架生成与序列设计耦合,可从生成的骨架几何推断概率化残基对状态,并将二元与分型对信号作为软注意力偏置传递给序列解码。项目提供无条件生成流水线(sample → rank → refold,支持 TM ≥ 0.45 且 RMSD ≤ 5.5 的联合有效性评估)、固定骨架逆折叠解码(greedy / argmax / mutual 规则)等脚本,模型权重以预印本形式发布,采用 Apache-2.0 许可证,并支持 gRNAde 外部对照实验。
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