LLMmind_project：测量预训练语言与视觉模型和人脑活动表征对齐的 Snakemake 流水线

LLMmind 是一个用 Claude Code 辅助编写的 Snakemake 流水线，通过最近邻图重叠衡量预训练语言和视觉模型的内部表征与 fMRI 人脑活动（200 个脑区的 per-stimulus ISC）的对齐程度。流水线支持 cosine、Pearson、Spearman 相似度，提供置换检验与超几何显著性检验，并计算模型-模型对齐和 Spearman 秩相关作为补充指标，输出热图、折线图等汇总图表。完整运行一次约需 31 小时。