arXiv · cs.AI· Yuxuan Ren·· 14 天前AI 评分33
STAMP:一种面向片段级学习与编辑的拓扑感知分子语言
STAMP as a topology-aware molecular language for fragment-level learning and editing
来源与原文
arXiv · cs.AI
作者:Yuxuan Ren
发布时间:(北京时间)
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https://arxiv.org/abs/2610.18438v1
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AI 导读
研究者提出 STAMP(Sequential Tree Attachment-based Motif-Preserving representation),一种将片段级表示学习与精确结构编辑相连的拓扑感知分子语言。STAMP 分别编码 motif 身份、连接位点与树拓扑,在 30 个靶点中的 23 个上降低了活性悬崖预测误差,并在 23 个 benchmark 目标中的 15 个上于六种方法中排名第一。其确定性编译器使冻结语言模型能操作索引化片段,相比纯 SMILES 将分子编辑、优化、转换迁移与变化识别提升 9 至 56 个百分点。
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