arXiv · cs.AI· Yutong Hu·· 19 天前AI 评分22
VenusRX-Bench 基准与预训练模型 VenusRX：解析酶促反应空间
Elucidating the Space of Enzymatic Reaction: A Unified Benchmark and Pretrained Model
来源与原文
arXiv · cs.AI
作者：Yutong Hu
发布时间：（北京时间）
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https://arxiv.org/abs/2610.11694v1
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AI 导读
研究者提出 VenusRX-Bench 统一基准，涵盖正向反应预测、单步逆合成和 EC 编号预测，揭示化学模型与酶模型间存在明显的化学-酶促领域鸿沟。为弥合差距，团队开发 T5-style 序列到序列模型 VenusRX，采用两阶段训练，先在数百万条模板扩展反应上预训练，再在真实生化反应上训练，并支持可选 EC 条件化与 Molecule Library-Constrained Decoding。VenusRX 在多数评测设置上达到最佳或具竞争力的表现，且 EC 信息可提升反应预测，呈现反应结构与催化功能间的双向关系。
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