PLICDiff：基于 PLI 条件的蛋白质口袋配体 3D 扩散模型开源仓库

GitHub 新开源仓库 PLICDiff 提供一个 PLI 条件化的 3D 扩散框架，用于蛋白质口袋配体生成，采用 classifier-free guidance（CFG），用 PLIP 衍生的蛋白原子相互作用标签驱动图注意力编码器与几何扩散骨干。代码已在 Linux x86_64 上以 Python 3.11、PyTorch 2.4.0、PyG 2.7.0 验证，预训练 checkpoint（默认 checkpoint/9430000.pt）需另行下载，数据预处理基于 CrossDocked 并遵循 TargetDiff 流程。