DBCLS 推出 TogoMCP:AI 助手经 SPARQL 查询生命科学数据库
先了解这件事
日本 DBCLS 发布开源项目 TogoMCP(dbcls/togomcp),这是一个 MCP 服务器,让 Claude 等 AI 助手通过 SPARQL 访问 RDF Portal 及 GlyCosmos、TogoVar、UniProt、ChEMBL、PDB、PubChem 等生物医学数据库的公开端点与 REST API。 项目提供免安装的远程托管服务、本地安装(需 Python 3.11 以上及 uv)和 Docker compose 三种部署方式。KEGG 工具默认关闭,需设置 TOGOMCP_ENABLE_KEGG=1 且仅限本地 stdio 使用,且 KEGG API 按其条款仅限学术机构人员学术用途。可选设置 TOGOMCP_QUERY_LOG 后可将每次工具调用记录为 JSON 行,IP 默认以加盐哈希存储。
AI 根据报道生成 · 10 小时前更新
报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
- GitHub · 灵魂体仓库TogoMCP:面向生命科学数据库的 MCP Server(dbcls/togomcp)
DBCLS 的 TogoMCP 是一个 MCP 服务器,让 Claude 等 AI 助手通过 SPARQL 访问 RDF Portal 及 GlyCosmos、TogoVar、UniProt、ChEMBL、PDB、PubChem 等生物医学数据库的公开端点与 REST API。支持免安装的远程托管服务、本地安装(Python >= 3.11 + uv)、Docker compose 部署,KEGG 工具默认关闭,需设置 TOGOMCP_ENABLE_KEGG=1 且仅限本地 stdio 使用。可选的 TOGOMCP_QUERY_LOG 能将每次工具调用记录为 JSON 行,IP 默认以加盐哈希存储。
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